学校前身为1949年11月创建的东北机械农场技术训练班，后发展为黑龙江农业机械化学校2021年3月，黑龙江农业机械化学校升格为黑龙江农业工程职业学院2019年12月，被教育部财政部列入第三类高水平专业群建设单位B档2022。
